Дачная жизнь биоинформатиков
Уже четвертый год подряд Институт биоинформатики и Университет ИТМО проводят выездной семинар по системной биологии в загородном клубе «Дача». Софья КУЛЬМИНСКАЯ узнала, что думают лекторы Максим Артемов и Александр Предеус по поводу прошедшего Systems Biology Workshop, и как пробежать огромную дистанцию без остановки.
Биоинформатика — сложная
и активно развивающаяся область науки, поэтому говорить о ней можно бесконечно. Ее специфика состоит в том, что для исследований берут результаты работы биологов и медиков. Для обработки полученных данных требуется экспертиза математиков и программистов. Конечный результат опять идет к биологам. Поэтому на семинаре мы привлекаем специалистов из двух отраслей: биологии и программирования. Такой симбиоз помогает найти решения для поиска генов.
Программа семинара состоит из нескольких блоков:
теоретические лекции, практическая часть и лекции, где методы разбираются на примере реальных исследований. Участники изучают такие темы, как введение в секвенирование, медицинская и популяционная генетика,
транскрипционная и эпигенетическая регуляция, метаболическая регуляция и введение в метаболомику.
Все темы раскрыть на семинаре невозможно,
поэтому мы приглашаем новых людей. Например, в прошлом году специальным гостем был Марк Дейли — один из основателей и лидеров современной статистической генетики. Участники семинара прослушали лекцию Марка, а потом в неформальной обстановке задавали интересующие их вопросы. Это было очень живое обсуждение.
Помимо специалистов в области генетики,
мы решили приглашать людей искусства и литературы. И вот два года назад ввели в программу «вечер разрядки». В этом году специальным гостем стал писатель Захар Прилепин. Он рассказал участникам семинара о своем творческом пути, как происходит процесс написания книги с эмоциональной точки зрения.
Мероприятие организуется для студентов,
аспирантов и научных сотрудников, которые получили базовые навыки и готовы перейти к новой стадии их использования в научном смысле. И, конечно, увидеть примеры такого применения на практике в медицине.
Мы проводим жесткий конкурсный отбор.
Все начинается в феврале, количество желающих достигает 100 человек, из которых по результату мы выбираем только 24 лучших. Это аспиранты, магистранты, студенты старших курсов бакалавриата со всей России. Мы стараемся приглашать и людей, которые имеют биологические экспериментальные знания, и специалистов вычислительной области.
Этим апрелем в Сиднее
мы проводили такой же Systems Biology Workshop. С уверенностью можем сказать, что в Петербурге уровень выше: более увлеченная и заинтересованная публика. Участники задают больше вопросов, так как занимаются наукой на весьма солидном рабочем уровне. Все-таки здесь сформировано общество, которое активно развивается, растет и учится благодаря усилиям Института биоинформатики и Университета ИТМО. Как раз на таких семинарах начинающие специалисты получают дополнительный толчок для дальнейшего развития.
Генами заниматься интересно.
Недавно вышла статья о гене PPARD. Это некий стоп-сигнал «хватит бегать, давай посидим и отдохнем» для мозга, когда организму не хватает
глюкозы. Хотя реальных запасов в организме предостаточно. При проведении опытов на грызунах обнаружилось, что при блокировке гена мыши стали бегать на 70 % дольше. Например, атлеты, тренируя силу волю, способны изменить химию организма. Они останавливают работу гена PPARD и продолжают бежать.
Еще почитать по теме
