Что ожидает биологов и информатиков на хакатоне BioHack?

Ежегодный хакатон по биоинформатике BioHack пройдет 1-3 марта в Петербурге. Корреспондент «Мегабайт» пообщался с менеджером по маркетингу EPAM Russia, руководителем организационного комитета хакатона, Анастасией Макаровой, и выяснил, как объединяют информатиков и биологов в одну команду, что можно успеть за 48 часов и зачем вообще проводить подобные мероприятия?

— Как появилась идея организовывать ежегодный хакатон по биоинформатике?

— Хакатоны в области биоинформатики и смежных областях часто проводятся в России: Medtech Hackathon, Биохакатон Сколково, GeneHack. Как-то так получилось, что BioHack стал одним из самых крупных хакатонов в России в этой области. Связано это с тем, что у EPAM есть подразделение Life Sciences, где реализуются масштабные проекты для крупнейших западных компаний в области медицины, генетики, фармакологии и биоинформатики. Мы уже на протяжении трех лет сотрудничаем с Институтом биоинформатики. Для EPAM особенно важны инициативы, стимулирующие развитие области, где объединение научных знаний и потенциала информационных технологий способно принести колоссальные результаты для сотен миллионов людей по всему.

— Какие цели вы преследуете?

— Наши основные цели — это развитие отраслевого профессионального сообщества и популяризация биоинформатики в целом. Традиционно сильная школа биоинформатики в Петербурге, Москве и Новосибирске. Именно в этих городах проводятся различные образовательные мероприятия: от годовых курсов до специальных конкурсов и хакатонов. На BioHack ежегодно подается более 350 заявок, участники приезжают из разных городов. Это способствует междисциплинарному общению и взаимодействию.

— Какие кейсы вы предлагаете в этом году?

— Наш хакатон отличается тем, что он в большей степени научный и задачи для работы на хакатоне представляют ведущие исследовательские центры и организации. На текущий период у нас уже идет сбор проектов. Те проекты, которые проходят оценку организационного комитета, публикуются на сайте. Сервис для анализа данных по болезни Альцгеймера, мобильное приложение для знакомства с основами биоинформатики, предсказание сайтов посадки транскрипционных факторов в геноме, модель, позволяющая предсказывать развитие нейродегенеративных заболеваний, нейросеть, которая по входным данным выдает матрицу, имитирующую HiC карту — это лишь некоторые проекты, предложенные в предыдущие годы.

— Как хакатон влияет на дальнейшую карьеру участников?

— Чаще всего результаты, которых добились ребята на хакатоне, публиковались в научных изданиях, что для молодых специалистов крайне важно. Участники знакомятся и работают с кураторами проектов и эта работа может в будущем привести к трудоустройству. Я знаю, как минимум, трех человек, которых пригласили на работу по итогам хакатона. Хоть это и не было нашей самоцелью, но по итогам двух прошлых хакатонов порядка 25 человек были трудоустроены в EPAM.

— Как формируются команды?

— У нас достаточно нетрадиционный подход к регистрации — она индивидуальная. Одна из задач хакатона — объединение биологов, бизнес-аналитиков, генетиков и программистов. Достаточно редко можно встретить готовую команду, которая обладала бы необходимыми компетенциями. Поэтому при регистрации необходимо рассказать о своем опыте и написать мотивационное письмо. Далее мы отбираем участников, и если они прошли всем составом команды, то на проект могут регистрироваться вместе. Второй этап происходит буквально за неделю до самого хакатона: мы отправляем участникам список проектов, и они могут выбрать понравившийся в зависимости от технических требований. И у них остается еще время, чтобы подготовиться к работе над проектом до начала хакатона.

— Искать решение 48 часов и, вероятно, не спать. Зачем создавать такие довольно экстремальные условия?

— Мы пообщались с партнерами, и оказалось, задачи очень сложные. Все они связаны с обработкой больших объемов данных, и, к сожалению, 24 часов не хватало, чтобы добиться реальных результатов. Также мы стараемся включить в программу общение и непосредственную работу с кураторами, лекции от экспертов. Еще нужно учитывать время презентации всех проектов в конце — это порядка трех часов. Поэтому 48 часов было определено как оптимальное время.

— Как вы относитесь к поиску информации в интернете во время решения кейсов?

— Чаще всего задачи ставятся кураторами, и этот вопрос мы отдаем на их усмотрение. Безусловно, при разработке проектов ребята используют готовые механики и инструменты. Но обязательным условием является, чтобы код был написан на хакатоне и выложен командой в открытый репозиторий.

— Если ты учишься на младших курсах бакалавриата, есть ли возможность поучаствовать в хакатоне?

— Мы ориентируемся на молодых специалистов. Это прежде всего студенты старших курсов, магистранты, аспиранты и выпускники, которые имеют знания в этой предметной области. За два года у нас был лишь один участник с первого курса, который большое внимание уделял биоинформатике еще со школы, и свой уровень он подтвердил пройденными курсами и полученными сертификатами. Для нас важно, чтобы человек действительно обладал серьезными навыками и готов был за 48 часов внести весомый вклад в создание проекта.

— Какими качествами должен обладать участник или команда, чтобы пройти отбор?

— Нет универсального борца для хакатона. Все зависит от мотивации: насколько он хочет реально участвовать и как подкрепляет свое желание с помощью знаний. Мы индивидуально оцениваем каждую заявку (а у нас их более 350 каждый год). Где-то нам нравится технический уровень, и он подкреплен пройденными курсами и сертификатами, где-то — личная мотивация, когда участник в письме может нам доказать, что ему жизненно важно участвовать в нашем хакатоне! А кто-то просто рассказывает о том, какой драйв он приобретает от участия в подобных мероприятиях и что для него это значит.

— Что бы вы порекомендовали ребятам, которые впервые участвуют в хакатоне?

— Сложно рекомендовать что-либо новичкам: это соревнование, и любой должен быть в той или иной сфере подготовленным. Нам не важно, какие проекты ребята делали до. Мы ждем всех, кто не боится трудностей и реально готов работать в течение 48 часов.

— Какие условия вы предоставляете участникам?

— Что касается организации хакатона на месте, то мы уже второй год будем проводить его в офисе EPAM. В первый раз площадкой был Университет ИТМО. У нас хорошо организовано пространство как для работы в группах, так и для отдыха. Мы обеспечиваем всех участников питанием, комфортными условиями пребывания на площадке, спальными местами и интернетом. Расходы же на дорогу участники несут самостоятельно.

Регистрация на мероприятие доступна по ссылке до 11 февраля.